El Instituto Curie y la Universidad de Burdeos se han asociado con Qubit Pharmaceuticals, una start-up franco-estadounidense fundada en 2020 y dedicada a la investigación de nuevos medicamentos basados ​​en la computación cuántica y la computación hiperbárica híbrida, para desarrollar nuevas terapias contra el cáncer. La asociación tiene su origen en un estudio publicado en la revista Cell en 2021, que destaca el papel de una enzima particular (TREX1) en la progresión de los tumores hacia etapas invasivas más peligrosas de la enfermedad. De ahí la idea de bloquear esta enzima con una molécula dirigida específicamente a ella para amplificar la eficacia de los tratamientos contra el cáncer. "TREX1 representa una diana de gran interés, que actúa sobre dos grandes ejes terapéuticos. "Lograr inhibirla permitiría aumentar significativamente la respuesta inmunitaria contra las células tumorales y bloquear los procesos metastásicos", afirma Nicolas Manel, investigador del Inserm y responsable del equipo 'Inmunidad innata' del Instituto Curie.

Acelerar las fases upstream

Para lograrlo, Qubit Pharmaceuticals pondrá a disposición de los equipos de investigación su plataforma de diseño de fármacos (llamada Atlas) para generar moléculas con el perfil adecuado para inhibir TREX1. Esta plataforma de diseño de moléculas se basa actualmente en la computación de alto rendimiento (HPC) clásica, basada en una máquina basada en la GPU de Nvidia. El principio de Atlas es modelar candidatos a fármacos y predecir sus interacciones con un objetivo determinado, en este caso la famosa enzima. La joven empresa, fundada por investigadores franceses y estadounidenses, acaba de anunciar, en colaboración con la Sorbona, que ha desarrollado un emulador cuántico, llamado Hyperion, equipado con el equivalente a 40 qubits, pero esta plataforma no está, por el momento, implicada en la colaboración con el Instituto Curie y la Universidad de Burdeos.

La identificación de los mejores candidatos para bloquear TREX1 mediante simulación HPC tiene como objetivo acelerar los primeros pasos que conducen al descubrimiento de nuevos fármacos. «Antes incluso de iniciar los ensayos clínicos, la selección de candidatos a fármacos es larga y costosa. Apoyándose en la simulación y la inteligencia artificial se acelerará considerablemente esta etapa para ofrecer a los pacientes un nuevo y prometedor tratamiento de inmunoterapia lo más rápidamente posible», explica Cécile Campagne, directora de Valorización y Asociaciones Industriales del Institut Curie y directora adjunta de Carnot Curie Cancer. Las pruebas biológicas y las caracterizaciones bioquímicas de las moléculas identificadas como los mejores candidatos serán realizadas por el Institut Curie y la Universidad de Burdeos.